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博士論文 / Phylogenetic uniqueness of Mycobacterium avium subspecies hominissuis isolated from an abnormal pulmonary bovine case 牛肺感染症を引き起こしたマイコバクテリウム・アビウム・ホミニシウスMycobacterium avium subspecies hominissuisの遺伝系統

著者

書誌事項

タイトル

Phylogenetic uniqueness of Mycobacterium avium subspecies hominissuis isolated from an abnormal pulmonary bovine case

タイトル別名

牛肺感染症を引き起こしたマイコバクテリウム・アビウム・ホミニシウスMycobacterium avium subspecies hominissuisの遺伝系統

著者名

吉田志緒美

学位授与大学

Nagasaki University (長崎大学) (大学ID:0073) (CAT機関ID:KI000877)

取得学位

博士(医学)

学位授与番号

甲医歯薬第1095号

学位授与年月日

2018-09-05

注記・抄録

Mycobacterium avium subspecies hominissuis (MAH) is an important cause of infection in human pulmonary and swine intestinal cases. Although MAH is isolated from environmental sources frequently, infections of other animals have rarely been analysed. Recently, we detected granulomatous inflammation in bovine lung as an abnormal postmortem inspection case. To ascertain its genetic profile, we conducted a variable numbers of tandem repeats (VNTR) analysis and genomic characterization using deep sequencing. The VNTR type was a unique profile that differed from reported genotypes, but it was assigned within a broad genotypic complex of isolates from human patients and bathrooms. Genomic comparison with 116 registered genome sequences of the subspecies revealed that the strain was separate from five major genetic population groups proposed previously. Although the infection source remains unclear, its isolation from various resources such as animal infection cases should be elucidated more extensively to reveal its genetic diversity and ecological context.

開始ページ : 122

終了ページ : 129

元資料の権利情報 : © 2018 Elsevier B.V. All rights reserved.

キーワード

Mycobacterium avium subspecies hominissuis, VNTR, Genomic comparison

各種コード

NII論文ID(NAID)

500001080998

NII著者ID(NRID)
  • 8000001205378
DOI (出版社)

10.1016/j.meegid.2018.04.013

DOI

info:doi/10.1016/j.meegid.2018.04.013

本文言語コード

eng

データ提供元

機関リポジトリ / NDLデジタルコレクション

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博士論文 / 長崎大学 / 医学

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